“中医治疗疫病用药规律与作用机制研究”获得了三项软件著作权和一项计算机设计大赛校级一等奖，这些成果对应的主要研究内容如下：
(1) 疫病“药方-中药-成分-靶点”模型设计
进行疫病的“药方-中药-成分-靶点”模型设计。研究如何构建包含中医治疗疫病所使用的药方、中药成分、药物靶点关系以及靶点蛋白质相互作用网络信息的模型。通过整理收集中医治疗疫病的药方，并利用网络爬虫技术获取现有中药、成分及靶点等相关数据库信息，以形成疫病“药方-中药-成分-靶点”模型。
(2) 疫病使用药对相似度衡量的计算方法设计
设计疫病药对相似度衡量的计算方法。基于计算的药物靶点预测分析方法建立在整合药方中的药对信息、药物靶点、药物副作用和相互作用组学等数据的基础上。探讨如何使用Frobenius范数和互信息熵两种算法从整体角度来衡量中药A与中药B之间的药对相似度，以推导已有药对的规律，并为潜在药对的查找奠定基础。
(3) 疫病药对快速查找算法及作用机制研究探索
探索疫病药对的快速查找算法及作用机制研究。通过改进的基于抽样的随机游走算法，结合建立的“药方-中药-成分-靶点”模型和全面有效的药对相似度衡量算法，快速查找潜在的治疗疫病有效药对。并通过中医医史文献和分子模拟研究验证所找到的药对在疫病治疗中的作用，从而深入研究药对配制的底层依据，预测中草药配对的潜在可能性，为中医辅助诊疗及药物研发提供帮助。
在上述研究内容中，“药方-中药-成分-靶点”模型的建立是基础，进而进行药对相似度衡量算法研究及新药对发现及作用机制研究探索。因此，模型的建立是本项目的关键点，而药对相似度全面有效衡量算法及潜在药对快速查找作用机制是本研究的重点。
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